IONpath高清晰度空间蛋白质组学在内的多组学方法

专业细胞在不断增加皮肤癌的边缘，降低免疫反应，斯坦福大学的研究人员在报告细胞。这项研究今天可以印刷，它结合了多种技术以单细胞水平的细节分析和精确定位鳞状细胞癌(一种常见的皮肤癌)的肿瘤微环境。

由医学博士，皮肤病学教授兼主席Paul Khavari博士，医学博士，医学博士Carl J. Herzog领导的斯坦福大学研究人员团队将单细胞分辨率多路离子束成像(MIBI™)与空间相结合转录组学和RNA测序可分析一系列人类皮肤鳞状细胞癌样品以及匹配的正常皮肤。目的是了解肿瘤生物学的空间背景，并确定引起耐药性的细胞类型。

“我们想通过多管齐下的方法获得高分辨率的肿瘤微环境视图。在我们的研究之前，我们不知道这种疾病中细胞组成的多样性如何，”临床医生Andrew Ji解释说，斯坦福医学院博士后研究员，合著者。“我们利用单细胞RNA测序技术来确定存在的细胞类型，但这需要解离样品，从而失去了它们的空间和生物学环境。没有这个关键的难题，我们将无法理解这些细胞如何可能影响其周围环境邻居。”

IONpath的高清空间蛋白质组学平台MIBI可在单个细胞的基础上提供具有空间内容的定量蛋白质表达。这使研究人员不仅能够查看存在的细胞和生物标记物，还可以查看它们之间的相对位置。

“通过单细胞RNA测序定义多种细胞类型的高通量能力凸显了传统成像和染色方法所面临的挑战，”微生物学和免疫学系联合首席作者兼博士后研究员江津津(Sizun Jiang)博士说。 ，美国斯坦福大学医学院。“ IONpath的下一代MIBI平台使我们能够以单细胞分辨率同时获得多种标记，从而将这些不同的细胞置于其天然环境中，并了解它们可能从事的行为。我们希望，这不仅会导致增进了对肿瘤生物学的了解，但有了一个用于分析和了解其他人类疾病的新框架。”

研究人员现在正在使用这种多组学方法来研究鳞状细胞癌以外的癌症类型，以提供新颖的见解并指导激活免疫系统并将其用于对抗癌症的新癌症疗法。